松平容保领着会津藩兵和城防兵英勇地在城墙上同城外的联军作战，京都所司代酒井忠义领着百余城防办精锐和新选组等数百名流浪武士在城内四处搜捕纵火的藩兵内应。
但城内的倒幕派武士也不下百人，四处放火更是难以防范，不到半日功夫，整个京都已经是一片火海。原本京都城内的百姓在以前的保元平治、应仁的战火后，就非常惧怕火灾。如今的大火比当初的火灾看起来还要猛烈，哪还有人有心思救火，于是乎，城内的平民和商贩纷纷出逃。这样一来，原本守城的会津藩兵和京都城防兵便兵力不足，再加上被城内的乱民和夹杂其中的藩士奸细作乱冲击，京都城的外城门一个不慎，便被城外的藩兵攻破了。
松平容保和酒井忠义连忙率领着数千手下放弃外都城，退守皇城。但此时，已经于事无补了。
京都城外，潮水般的长州藩兵和四国藩兵纷纷冲入被打开的城门，进入京都城内。
长州藩的国司信浓、益田右卫门介二名家老护卫着藩主毛利敬亲，亲自领兵开始攻击京都皇宫的蛤御门，镇守蛤御门的正是会津藩的藩主松平容保，双方展开激战。国司信浓更是下令长州藩兵架设火炮，轰击皇宫。
会津藩兵虽然英勇，但毕竟寡不敌众，渐渐不敌，坚持半天之后，会津藩兵战死近千人，京都城防兵死伤数百，眼见守不住了，松平容保率领一帮会津兵躲入皇宫之中，其余的守军尽皆逃散。
皇城也被攻破了。
御所的最深处，是一处御花园。
孝明天皇和皇妃中山庆子肩并肩站在一处山涧，看向山涧下的一处浅浅的水潭，漫山的绿叶红花，一片盛夏的美景，但透过这些枫树，身后皇宫处阵阵杀喊声传来。
没过多久，一阵嘈杂的脚步声进入御花园，几声惨叫响起之后，一名手持武士刀、身穿蓝色羽织的年轻武士，面无表情，却当先一脚踢开花园大门，领着数十名流浪武士冲了进来。
第888章 天皇驾崩
孝明天皇眉头一皱，也不回头，低喝道：“尔等何人手下朕乃天照大神的后裔，日本国的天皇，尔等竟敢如此放肆，不怕抄家灭族么”说罢，见身旁的妃子有些害怕得发抖，便轻轻握住中山庆子的手，轻声道：“看来松平容保他们败了你不要怕，一切有朕在，他们最多想挟持朕以天子令诸侯，不敢乱来的。”
但来人似乎并不吃这一套，而是扭头朝手下下达命令：“南贞助留下，其余的人，全部去把守好大门，没我的命令，不准任何人进出”
说完，扭头朝留下来的这名叫南贞助的只有十四五岁模样的年轻武士道：“你留在这里好好照料皇妃，我和陛下到凉亭里有事要谈。”
说完，竟头也不回地径直走进前面的凉亭内，稳稳地坐了下来，浑然没理会呆在一旁的天皇。
孝明天皇心中憋屈，却不知为何，竟不敢反对，明明对方只是一名年轻的低级武士而已，但他心中竟隐隐有种畏惧这个武士的感觉，跟着走入凉亭。
皇城外，桂小五郎领着一队藩兵，跟随着藩主毛利敬亲，走入蛤御门。
“小五郎此番能攻克京都，你的功劳最大等下进入皇宫，你可优先挑选一件战利品另外，抓获的那些新选组的浪人，都任由你来处置。”毛利敬亲亲热地拍了拍桂小五郎的肩膀，显得意气风发。
“谢藩主大人”桂小五郎连忙谢过。
“对了，小五郎，高杉晋作呢怎么没看见他”毛利敬亲没见到高杉晋作，随口问道。
“不是藩主大人派他有重要任务么”桂小五郎诧异回道。
毛利敬亲不以为意地回答：“没有啊。不管那么多了，先进天皇的御所，将天皇好好保护起来，千万不能伤到天皇陛下，还有”
他的话还没说完，他的心腹，长州藩的家老福原越后急急忙忙地从御所方向跑了过来，口中大叫：“藩主，不好了，不好了”
毛利敬亲眉头一皱，口中不悦道：“何事惊慌失措成这个样子。慢慢说。”
福原越后却脸色惨白，慌张得连话都说不利落，结结巴巴地道：“陛下，天皇陛下他，突突突然驾崩了”
“什么”毛利敬亲一个趔趄，差点摔倒在地，他一把掐住福原越后的胸口武士服，双眼通红，大吼道：“怎么回事谁干得”
“藩主，真真不是不是您下令的啊”福原越后更是惊慌，越发说不利索。
“八嘎”毛利敬亲一耳光将福原越后扇倒在地，“蠢猪，我什么时候下令过要杀天皇对我们长州藩有什么好处”说完，毛利敬亲还不解气，刷地抽出武士刀，便是一刀刺去，当场将福原越后刺死在地，然后急急忙忙朝御所跑去。
身后的桂小五郎，却呆立在一旁。他脑袋全然都蒙了，忽地想起了什么，浑身打了寒颤，连忙也跟着朝御所方向奔去。
踏进御所，饶是久经厮杀的桂小五郎，也是被眼前的一幕血腥给吓呆了。只见御所内，满是各种式样姿势的尸体，大部分都是一些宫内侍童，还有部分会津藩兵和京都城防兵，除少量是背部受创趴在地上之外，其余的大部分都是后仰而死，桂小五郎自然知道，这是反抗争斗过程中被正面杀死。其中有数十个身着蓝色羽织的浪人，虽然衣衫褴褛，满是伤痕，但桂小五郎却可以一眼看出，那不是受伤而死。果然，他凑近一具尸体，嘴角有黑色的血污，显然是中毒身亡，而且这么多个武士中毒，不是被毒杀便是服毒自尽，桂小五郎虽然粗心，但却也猜测后者可能性更大一些。